"Cytoscape Web"について "バイオインフォマティクス砂漠" "Cytoscape_User_Manual"

メモ： f=open("Attributes.noa","w") f.write('') #文字列 s をファイルに書き込む f.writelines('') #リスト x に格納された文字列をファイルに書き込む f.close() 目的出力ーexample FunctionalCategory YAL001C = metabolism YAR002W = apoptosis YBL007…

PRMLの定義に従ってk-meansアルゴリズム書いたった。 汚いのであとで整形する予定 とりあえずn次元のクラスタに分けることが可能。 import numpy as np import pylab as plt #クラスタの数 K=2 data=np.genfromtxt("faithful.txt") X=standardizing(data) #…

"神経科学と日常概念―リベットの自由意志研究をめぐって―" リベットの実験に対する議論について調べる必要性を感じたので調べていたらこんな議論があったので みました。リベットの実験自体はある程度流れをおさえていた。 以下の論文気になったので調べる（…

"numpy.diagflat" In [120]: X Out[120]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) In [121]: np.diagflat(X) Out[121]: array([[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0,…

Euler Projectを時間見つけて解いていく感じのまとめ。"解答1~5" "解答6~10" "解答11~15"

データの分類「これなら分かる最適化数学」p145 について、次のような問題ありました。 一次元なので次は多次元でやります。ええ。[改・例題5.4] それぞれ平均、分散、 の正規分布から独立に発生した個のデータが総数個のデータ{},を観測したとする。 これを…

(())研究でEMアルゴリズムを使うので、資料を集めました。 １０日までにベイズ線形回帰もしたい。"混合ガウスモデルとEM" 結構有名（？）な人工知能に関する断想録"初めてのEMアルゴリズム with R" NAISTの学生の方の日記"ぽんのブログ" エンジニア（？）の…

入力誤差モデルについて p140を参考にして書いた。 まぁサンプルと思ってください。出力誤差モデル→入力x後に誤差が加わったのがyと解釈 入力誤差モデル→真の座標(x,y)にそれぞれ誤差が加わったと解釈どっちが適切かは判断できない。まぁ解釈する側の問題な…